很久以前銀河系是和平的，這個天堂由科學之手維持秩序。而科學之手，指的就是銀河系的主宰─核心。

　　矛盾的是終極的勝利卻帶來樂園的崩潰和數以百萬個星球的滅亡。戰爭的起因是一種叫"鑄造"的程序，它能夠把人腦和意識轉移到不死的機器上，這是不道德的行為，但核心下令強制所有市民接受鑄造以確保自身的安全。

　　有許多不愿身體物化的人，認為鑄造是一種暴政。他們群聚在銀河 的邊緣反抗核心的統治，被稱為武力。於是，雖然沒有宣戰，戰爭卻已展開。武力為武士開發了高能戰斗服，對手就是經過鑄造的不死機器，核心不斷復制最強的戰士，武力也堅強的反攻。戰爭延續 了4,000年，幾乎耗盡銀河系的資源，僅存一片焦土。

　　雙方都已兵疲馬頓、人員死傷殆盡。剩余的人馬正準備作最后的決戰，他們只有散處各地的殘余兵力，在戰火蹂躪的土地上對峙，為理念而戰、至死方休。唯一的結果是其中一方將敵人徹底消滅。

　　"核子"輸掉了4,000年來與"武力"對抗的戰爭，銀河系即將由武力(ARM)進行重整，但是傳說中戰爭末期核子指揮官(Core Commander)在機密的復活計畫中活存下來竟然成真!核子與武力雙方正競相發展新的外星科技，唯一幸存的CORE欲藉此徹底摧毀ARM及銀河系。 一觸即發的核子風云就要開始了…